Ubiquitin System (Salicornia europaea)
Method. Proteins were annotated using UUCD-derived HMM profiles and family-specific score cutoffs with HMMER (hmmsearch).
- +DUB(31 genes, 4 categories)
- +JAMM(4 genes)
- +UCH(1 genes)
- +ULP(2 genes)
- +USP(24 genes)
- +E1(6 genes)
- +E2(34 genes, 2 categories)
- +UBC(33 genes)
- Seu_jg1064
- Seu_jg1293
- Seu_jg2812
- Seu_jg2955
- Seu_jg2959
- Seu_jg3391
- Seu_jg4918
- Seu_jg5152
- Seu_jg5473
- Seu_jg5789
- Seu_jg5940
- Seu_jg6027
- Seu_jg8540
- Seu_jg9061
- Seu_jg9296
- Seu_jg9681
- Seu_jg10075
- Seu_jg11587
- Seu_jg12005
- Seu_jg12304
- Seu_jg15645
- Seu_jg15680
- Seu_jg18795
- Seu_jg21020
- Seu_jg21264
- Seu_jg21467
- Seu_jg21494
- Seu_jg23732
- Seu_jg24422
- Seu_jg25713
- Seu_jg26462
- Seu_jg28333
- Seu_jg28629
- +UEV(1 genes)
- +E3_activity(380 genes, 5 categories)
- +DCUN1(1 genes)
- +HECT(7 genes)
- +N-recognin(1 genes, 1 categories)
- +UBR-box(1 genes)
- +RBR(0 genes, 1 categories)
- +RING(368 genes, 3 categories)
- +PHD(22 genes)
- +RING(285 genes)
- Seu_jg102
- Seu_jg271
- Seu_jg272
- Seu_jg274
- Seu_jg275
- Seu_jg279
- Seu_jg280
- Seu_jg281
- Seu_jg295
- Seu_jg296
- Seu_jg297
- Seu_jg298
- Seu_jg299
- Seu_jg300
- Seu_jg301
- Seu_jg317
- Seu_jg421
- Seu_jg476
- Seu_jg633
- Seu_jg900
- Seu_jg1033
- Seu_jg1175
- Seu_jg1712
- Seu_jg1812
- Seu_jg1818
- Seu_jg2072
- Seu_jg2150
- Seu_jg2316
- Seu_jg2587
- Seu_jg2665
- Seu_jg2668
- Seu_jg2696
- Seu_jg2710
- Seu_jg2718
- Seu_jg2736
- Seu_jg2795
- Seu_jg2819
- Seu_jg2974
- Seu_jg2980
- Seu_jg2989
- Seu_jg3032
- Seu_jg3153
- Seu_jg3275
- Seu_jg3331
- Seu_jg3364
- Seu_jg3368
- Seu_jg3548
- Seu_jg3774
- Seu_jg3939
- Seu_jg3956
- Seu_jg3965
- Seu_jg4129
- Seu_jg4675
- Seu_jg4829
- Seu_jg4920
- Seu_jg4939
- Seu_jg5303
- Seu_jg5482
- Seu_jg5499
- Seu_jg5567
- Seu_jg5570
- Seu_jg5573
- Seu_jg5574
- Seu_jg5842
- Seu_jg5856
- Seu_jg5943
- Seu_jg5952
- Seu_jg5979
- Seu_jg5991
- Seu_jg6069
- Seu_jg6174
- Seu_jg6227
- Seu_jg6274
- Seu_jg6356
- Seu_jg6526
- Seu_jg6568
- Seu_jg6620
- Seu_jg6624
- Seu_jg6638
- Seu_jg6744
- Seu_jg7049
- Seu_jg7212
- Seu_jg7993
- Seu_jg8063
- Seu_jg8447
- Seu_jg8507
- Seu_jg8751
- Seu_jg8823
- Seu_jg8874
- Seu_jg9036
- Seu_jg9037
- Seu_jg9094
- Seu_jg9324
- Seu_jg9378
- Seu_jg9379
- Seu_jg9381
- Seu_jg10340
- Seu_jg10428
- Seu_jg11201
- Seu_jg11237
- Seu_jg11239
- Seu_jg11282
- Seu_jg11468
- Seu_jg11505
- Seu_jg11646
- Seu_jg11664
- Seu_jg11677
- Seu_jg11679
- Seu_jg11746
- Seu_jg12119
- Seu_jg12138
- Seu_jg12165
- Seu_jg12251
- Seu_jg12291
- Seu_jg12293
- Seu_jg12302
- Seu_jg12469
- Seu_jg12613
- Seu_jg12670
- Seu_jg13002
- Seu_jg13008
- Seu_jg13308
- Seu_jg13482
- Seu_jg13742
- Seu_jg13760
- Seu_jg13793
- Seu_jg13822
- Seu_jg14301
- Seu_jg14349
- Seu_jg14350
- Seu_jg14352
- Seu_jg14385
- Seu_jg14536
- Seu_jg14791
- Seu_jg14943
- Seu_jg15018
- Seu_jg15037
- Seu_jg15065
- Seu_jg15081
- Seu_jg15100
- Seu_jg15230
- Seu_jg15302
- Seu_jg15445
- Seu_jg15599
- Seu_jg15966
- Seu_jg15970
- Seu_jg15992
- Seu_jg16040
- Seu_jg16078
- Seu_jg16279
- Seu_jg16463
- Seu_jg16467
- Seu_jg16612
- Seu_jg16908
- Seu_jg17086
- Seu_jg17169
- Seu_jg17172
- Seu_jg17374
- Seu_jg17387
- Seu_jg17551
- Seu_jg18001
- Seu_jg18002
- Seu_jg18003
- Seu_jg18004
- Seu_jg18195
- Seu_jg18318
- Seu_jg18338
- Seu_jg18411
- Seu_jg18441
- Seu_jg18477
- Seu_jg18656
- Seu_jg18692
- Seu_jg18781
- Seu_jg18856
- Seu_jg18865
- Seu_jg18904
- Seu_jg19070
- Seu_jg19234
- Seu_jg19312
- Seu_jg19381
- Seu_jg19432
- Seu_jg19581
- Seu_jg19599
- Seu_jg19692
- Seu_jg19693
- Seu_jg19720
- Seu_jg19789
- Seu_jg19847
- Seu_jg19915
- Seu_jg19916
- Seu_jg19958
- Seu_jg20006
- Seu_jg20013
- Seu_jg20063
- Seu_jg20115
- Seu_jg20175
- Seu_jg20272
- Seu_jg20286
- Seu_jg20462
- Seu_jg20473
- Seu_jg20492
- Seu_jg20526
- Seu_jg20652
- Seu_jg20735
- Seu_jg20897
- Seu_jg20998
- Seu_jg21004
- Seu_jg21028
- Seu_jg21029
- Seu_jg21145
- Seu_jg21195
- Seu_jg21200
- Seu_jg21202
- Seu_jg21204
- Seu_jg21253
- Seu_jg21691
- Seu_jg22272
- Seu_jg22365
- Seu_jg22759
- Seu_jg22824
- Seu_jg22837
- Seu_jg23053
- Seu_jg23178
- Seu_jg23239
- Seu_jg23247
- Seu_jg23441
- Seu_jg23793
- Seu_jg23957
- Seu_jg24048
- Seu_jg24119
- Seu_jg24263
- Seu_jg24312
- Seu_jg24314
- Seu_jg24628
- Seu_jg24638
- Seu_jg24673
- Seu_jg24997
- Seu_jg25154
- Seu_jg25227
- Seu_jg25341
- Seu_jg25466
- Seu_jg25494
- Seu_jg25565
- Seu_jg25594
- Seu_jg25764
- Seu_jg25801
- Seu_jg25827
- Seu_jg25846
- Seu_jg25932
- Seu_jg25937
- Seu_jg25998
- Seu_jg26018
- Seu_jg26052
- Seu_jg26109
- Seu_jg26125
- Seu_jg26186
- Seu_jg26423
- Seu_jg26424
- Seu_jg26425
- Seu_jg26426
- Seu_jg26427
- Seu_jg26429
- Seu_jg26430
- Seu_jg26431
- Seu_jg26632
- Seu_jg26791
- Seu_jg26793
- Seu_jg27029
- Seu_jg27113
- Seu_jg27193
- Seu_jg27266
- Seu_jg27279
- Seu_jg27303
- Seu_jg27443
- Seu_jg27501
- Seu_jg27638
- Seu_jg27834
- Seu_jg28142
- Seu_jg28291
- Seu_jg28599
- Seu_jg28610
- Seu_jg28628
- Seu_jg28653
- Seu_jg28668
- Seu_jg28696
- +U-box(61 genes)
- Seu_jg532
- Seu_jg1818
- Seu_jg1926
- Seu_jg2561
- Seu_jg2966
- Seu_jg2980
- Seu_jg3192
- Seu_jg4939
- Seu_jg5923
- Seu_jg5925
- Seu_jg5926
- Seu_jg8063
- Seu_jg8905
- Seu_jg9184
- Seu_jg9253
- Seu_jg9389
- Seu_jg9431
- Seu_jg9865
- Seu_jg10128
- Seu_jg10340
- Seu_jg11201
- Seu_jg11400
- Seu_jg13308
- Seu_jg13742
- Seu_jg14462
- Seu_jg14502
- Seu_jg14676
- Seu_jg15017
- Seu_jg15018
- Seu_jg15100
- Seu_jg15149
- Seu_jg15150
- Seu_jg15366
- Seu_jg15367
- Seu_jg15368
- Seu_jg15369
- Seu_jg15408
- Seu_jg16274
- Seu_jg17169
- Seu_jg17493
- Seu_jg18207
- Seu_jg18324
- Seu_jg18673
- Seu_jg18781
- Seu_jg18865
- Seu_jg18904
- Seu_jg20128
- Seu_jg20476
- Seu_jg21028
- Seu_jg23178
- Seu_jg23247
- Seu_jg23441
- Seu_jg25519
- Seu_jg25846
- Seu_jg26109
- Seu_jg26596
- Seu_jg26853
- Seu_jg28229
- Seu_jg28291
- Seu_jg28612
- Seu_jg28653
- +E3_adaptor(422 genes, 1 categories)
- +Cullin_RING(422 genes, 5 categories)
- +APC_C(5 genes, 1 categories)
- +CDC20(5 genes)
- +BCR(36 genes, 1 categories)
- +BTB(36 genes)
- Seu_jg1841
- Seu_jg2654
- Seu_jg3243
- Seu_jg4869
- Seu_jg5659
- Seu_jg6014
- Seu_jg7160
- Seu_jg7849
- Seu_jg9136
- Seu_jg9170
- Seu_jg9179
- Seu_jg10415
- Seu_jg12227
- Seu_jg12231
- Seu_jg12734
- Seu_jg13145
- Seu_jg13606
- Seu_jg14460
- Seu_jg15207
- Seu_jg15346
- Seu_jg15569
- Seu_jg16202
- Seu_jg16441
- Seu_jg16955
- Seu_jg16956
- Seu_jg17744
- Seu_jg17972
- Seu_jg18138
- Seu_jg18664
- Seu_jg19101
- Seu_jg19522
- Seu_jg24002
- Seu_jg24634
- Seu_jg25313
- Seu_jg25976
- Seu_jg28716
- +Cullin(4 genes)
- +DCX(208 genes, 2 categories)
- +DDB1(1 genes)
- +DWD(207 genes)
- Seu_jg167
- Seu_jg218
- Seu_jg379
- Seu_jg460
- Seu_jg653
- Seu_jg660
- Seu_jg791
- Seu_jg792
- Seu_jg936
- Seu_jg1141
- Seu_jg1818
- Seu_jg1960
- Seu_jg2171
- Seu_jg2382
- Seu_jg2438
- Seu_jg2513
- Seu_jg2702
- Seu_jg3170
- Seu_jg3224
- Seu_jg3235
- Seu_jg3326
- Seu_jg3354
- Seu_jg3615
- Seu_jg3756
- Seu_jg3800
- Seu_jg3896
- Seu_jg4111
- Seu_jg4635
- Seu_jg4652
- Seu_jg4871
- Seu_jg4883
- Seu_jg4907
- Seu_jg4976
- Seu_jg5065
- Seu_jg5097
- Seu_jg5143
- Seu_jg5188
- Seu_jg5605
- Seu_jg5687
- Seu_jg5736
- Seu_jg5780
- Seu_jg5922
- Seu_jg6034
- Seu_jg6105
- Seu_jg6110
- Seu_jg6174
- Seu_jg6280
- Seu_jg6455
- Seu_jg6635
- Seu_jg6645
- Seu_jg6800
- Seu_jg6837
- Seu_jg7325
- Seu_jg7828
- Seu_jg8035
- Seu_jg8059
- Seu_jg8131
- Seu_jg8233
- Seu_jg8269
- Seu_jg8293
- Seu_jg8480
- Seu_jg8851
- Seu_jg8902
- Seu_jg9089
- Seu_jg9101
- Seu_jg9371
- Seu_jg9390
- Seu_jg9405
- Seu_jg9429
- Seu_jg9489
- Seu_jg9624
- Seu_jg10340
- Seu_jg11100
- Seu_jg11150
- Seu_jg11272
- Seu_jg11394
- Seu_jg11451
- Seu_jg11497
- Seu_jg11609
- Seu_jg12094
- Seu_jg12195
- Seu_jg12208
- Seu_jg12252
- Seu_jg12309
- Seu_jg12526
- Seu_jg12688
- Seu_jg12919
- Seu_jg13358
- Seu_jg13560
- Seu_jg13751
- Seu_jg13886
- Seu_jg14265
- Seu_jg14433
- Seu_jg14621
- Seu_jg14640
- Seu_jg14665
- Seu_jg14697
- Seu_jg15064
- Seu_jg15197
- Seu_jg15198
- Seu_jg15204
- Seu_jg15518
- Seu_jg15560
- Seu_jg15688
- Seu_jg15735
- Seu_jg16003
- Seu_jg16011
- Seu_jg16020
- Seu_jg16295
- Seu_jg16477
- Seu_jg16804
- Seu_jg16991
- Seu_jg17076
- Seu_jg18209
- Seu_jg18298
- Seu_jg18359
- Seu_jg18374
- Seu_jg18479
- Seu_jg18519
- Seu_jg18584
- Seu_jg18834
- Seu_jg18901
- Seu_jg19050
- Seu_jg19051
- Seu_jg19055
- Seu_jg19141
- Seu_jg19151
- Seu_jg19210
- Seu_jg19368
- Seu_jg19396
- Seu_jg19446
- Seu_jg19453
- Seu_jg19515
- Seu_jg19527
- Seu_jg19547
- Seu_jg19665
- Seu_jg19857
- Seu_jg19881
- Seu_jg19941
- Seu_jg19954
- Seu_jg20144
- Seu_jg20167
- Seu_jg20193
- Seu_jg20220
- Seu_jg20283
- Seu_jg20286
- Seu_jg20296
- Seu_jg20610
- Seu_jg20716
- Seu_jg20778
- Seu_jg20833
- Seu_jg20871
- Seu_jg20872
- Seu_jg20874
- Seu_jg20915
- Seu_jg20986
- Seu_jg21101
- Seu_jg21174
- Seu_jg21202
- Seu_jg21471
- Seu_jg21536
- Seu_jg22194
- Seu_jg22205
- Seu_jg22253
- Seu_jg23134
- Seu_jg23231
- Seu_jg23286
- Seu_jg23298
- Seu_jg23419
- Seu_jg23533
- Seu_jg23608
- Seu_jg23667
- Seu_jg23895
- Seu_jg24141
- Seu_jg24317
- Seu_jg24479
- Seu_jg24885
- Seu_jg24934
- Seu_jg25191
- Seu_jg25213
- Seu_jg25322
- Seu_jg25335
- Seu_jg25570
- Seu_jg25690
- Seu_jg25809
- Seu_jg25910
- Seu_jg25936
- Seu_jg25981
- Seu_jg26203
- Seu_jg26279
- Seu_jg26292
- Seu_jg26345
- Seu_jg26488
- Seu_jg26761
- Seu_jg26852
- Seu_jg27077
- Seu_jg27408
- Seu_jg27550
- Seu_jg27589
- Seu_jg28193
- Seu_jg28229
- Seu_jg28266
- Seu_jg28294
- Seu_jg28397
- Seu_jg28415
- Seu_jg28557
- Seu_jg28655
- +SCF(169 genes, 2 categories)
- +F-box(167 genes)
- Seu_jg179
- Seu_jg185
- Seu_jg345
- Seu_jg423
- Seu_jg592
- Seu_jg618
- Seu_jg1003
- Seu_jg1088
- Seu_jg1185
- Seu_jg1717
- Seu_jg1730
- Seu_jg1803
- Seu_jg1947
- Seu_jg1953
- Seu_jg2147
- Seu_jg2239
- Seu_jg2257
- Seu_jg2373
- Seu_jg2385
- Seu_jg2491
- Seu_jg3235
- Seu_jg3813
- Seu_jg4625
- Seu_jg4882
- Seu_jg5138
- Seu_jg5434
- Seu_jg5504
- Seu_jg5657
- Seu_jg5849
- Seu_jg6070
- Seu_jg6211
- Seu_jg6374
- Seu_jg6549
- Seu_jg6824
- Seu_jg6999
- Seu_jg7022
- Seu_jg7074
- Seu_jg7169
- Seu_jg7393
- Seu_jg7686
- Seu_jg7781
- Seu_jg7899
- Seu_jg8441
- Seu_jg8456
- Seu_jg8532
- Seu_jg8759
- Seu_jg8760
- Seu_jg8786
- Seu_jg9040
- Seu_jg9075
- Seu_jg9254
- Seu_jg9285
- Seu_jg9382
- Seu_jg9688
- Seu_jg9833
- Seu_jg10045
- Seu_jg10048
- Seu_jg10051
- Seu_jg10053
- Seu_jg10055
- Seu_jg10056
- Seu_jg10057
- Seu_jg10061
- Seu_jg10142
- Seu_jg10460
- Seu_jg10870
- Seu_jg10922
- Seu_jg11106
- Seu_jg11331
- Seu_jg12134
- Seu_jg12234
- Seu_jg12637
- Seu_jg12988
- Seu_jg13014
- Seu_jg13133
- Seu_jg13401
- Seu_jg13827
- Seu_jg14383
- Seu_jg14445
- Seu_jg14451
- Seu_jg14503
- Seu_jg14639
- Seu_jg15056
- Seu_jg15849
- Seu_jg15901
- Seu_jg15904
- Seu_jg15927
- Seu_jg15935
- Seu_jg16011
- Seu_jg16022
- Seu_jg16056
- Seu_jg16304
- Seu_jg16356
- Seu_jg16403
- Seu_jg16407
- Seu_jg16526
- Seu_jg16630
- Seu_jg16631
- Seu_jg17091
- Seu_jg17099
- Seu_jg17160
- Seu_jg17880
- Seu_jg17881
- Seu_jg18048
- Seu_jg18485
- Seu_jg18609
- Seu_jg18618
- Seu_jg18863
- Seu_jg18961
- Seu_jg19132
- Seu_jg19583
- Seu_jg19990
- Seu_jg20421
- Seu_jg20786
- Seu_jg20871
- Seu_jg20876
- Seu_jg20880
- Seu_jg21273
- Seu_jg21541
- Seu_jg21555
- Seu_jg21695
- Seu_jg21998
- Seu_jg22096
- Seu_jg22159
- Seu_jg22608
- Seu_jg22737
- Seu_jg23585
- Seu_jg23587
- Seu_jg23591
- Seu_jg23593
- Seu_jg23794
- Seu_jg23917
- Seu_jg23919
- Seu_jg24274
- Seu_jg24474
- Seu_jg25055
- Seu_jg25398
- Seu_jg25438
- Seu_jg25612
- Seu_jg25634
- Seu_jg25636
- Seu_jg25637
- Seu_jg25638
- Seu_jg26066
- Seu_jg26195
- Seu_jg26284
- Seu_jg26326
- Seu_jg26338
- Seu_jg26406
- Seu_jg26407
- Seu_jg26558
- Seu_jg26590
- Seu_jg26671
- Seu_jg26909
- Seu_jg27124
- Seu_jg27786
- Seu_jg27943
- Seu_jg27946
- Seu_jg28387
- Seu_jg28403
- Seu_jg28405
- Seu_jg28463
- Seu_jg28588
- Seu_jg28606
- Seu_jg28633
- Seu_jg28690
- Seu_jg28729
- +SKP1(2 genes)
- +UBD(116 genes, 4 categories)
- +Alpha-Helix(31 genes, 4 categories)
- +CUE(1 genes)
- +UBA(22 genes)
- +UBM(1 genes)
- +UIM(7 genes)
- +Beta-Prp(55 genes)
- Seu_jg167
- Seu_jg460
- Seu_jg660
- Seu_jg936
- Seu_jg2382
- Seu_jg3224
- Seu_jg3756
- Seu_jg5143
- Seu_jg5188
- Seu_jg6635
- Seu_jg6800
- Seu_jg7325
- Seu_jg8035
- Seu_jg8293
- Seu_jg8851
- Seu_jg8902
- Seu_jg9089
- Seu_jg9371
- Seu_jg9390
- Seu_jg9489
- Seu_jg11150
- Seu_jg11272
- Seu_jg13560
- Seu_jg13886
- Seu_jg14621
- Seu_jg15064
- Seu_jg15204
- Seu_jg15688
- Seu_jg16003
- Seu_jg18209
- Seu_jg18298
- Seu_jg18479
- Seu_jg18834
- Seu_jg19151
- Seu_jg19515
- Seu_jg19881
- Seu_jg20167
- Seu_jg20220
- Seu_jg20296
- Seu_jg20716
- Seu_jg20778
- Seu_jg20874
- Seu_jg22253
- Seu_jg23419
- Seu_jg23533
- Seu_jg23667
- Seu_jg24934
- Seu_jg25191
- Seu_jg25570
- Seu_jg25910
- Seu_jg25981
- Seu_jg28229
- Seu_jg28266
- Seu_jg28415
- Seu_jg28655
- +UBC-like(27 genes, 2 categories)
- +UBD_UBC(26 genes)
- +UBD_UEV(1 genes)
- +ZnF(3 genes, 2 categories)
- +NZF(1 genes)
- +ZnF_UBP(2 genes)
- +ULD(98 genes, 2 categories)
- +UBL(14 genes, 3 categories)
- +ATG8(3 genes)
- +NEDD8(9 genes)
- +SUMO(2 genes)
- +UDP(84 genes, 2 categories)
- +UBQ(70 genes, 2 categories)
- +UBQ_Other(45 genes)
- Seu_jg2401
- Seu_jg4870
- Seu_jg5106
- Seu_jg5209
- Seu_jg6049
- Seu_jg6068
- Seu_jg6085
- Seu_jg8188
- Seu_jg8408
- Seu_jg9599
- Seu_jg9742
- Seu_jg9877
- Seu_jg12143
- Seu_jg12337
- Seu_jg12496
- Seu_jg12727
- Seu_jg14402
- Seu_jg15180
- Seu_jg15310
- Seu_jg15355
- Seu_jg15568
- Seu_jg15861
- Seu_jg16067
- Seu_jg16368
- Seu_jg16636
- Seu_jg17582
- Seu_jg18857
- Seu_jg18960
- Seu_jg19264
- Seu_jg19292
- Seu_jg20967
- Seu_jg21655
- Seu_jg24201
- Seu_jg24247
- Seu_jg25683
- Seu_jg26318
- Seu_jg26319
- Seu_jg26389
- Seu_jg26606
- Seu_jg26782
- Seu_jg27621
- Seu_jg28171
- Seu_jg28173
- Seu_jg28177
- Seu_jg28347
- +UBQ_PIM(25 genes)
- +UFD(14 genes, 2 categories)