Ubiquitin System (Populus euphratica)
Method. Proteins were annotated using UUCD-derived HMM profiles and family-specific score cutoffs with HMMER (hmmsearch).
- +DUB(59 genes, 4 categories)
- +JAMM(2 genes)
- +UCH(1 genes)
- +ULP(9 genes)
- +USP(47 genes)
- populus_peu00224.t1
- populus_peu00439.t1
- populus_peu00570.t1
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- +E1(10 genes)
- +E2(71 genes, 2 categories)
- +UBC(67 genes)
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- populus_peu37990.t1
- +UEV(4 genes)
- +E3_activity(662 genes, 5 categories)
- +DCUN1(1 genes)
- +HECT(12 genes)
- +N-recognin(1 genes, 1 categories)
- +UBR-box(1 genes)
- +RBR(0 genes, 1 categories)
- +RING(643 genes, 3 categories)
- +PHD(29 genes)
- populus_peu01878.t1
- populus_peu05003.t2
- populus_peu06554.t2
- populus_peu08313.t1
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- populus_peu36528.t2
- populus_peu38082.t1
- +RING(494 genes)
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