Protein Kinases (Nitraria sibirica)
Method. Protein kinases were predicted by iTAK.
-
+ Group AGC (30 genes, 6 families)
-
+ AGC-Pl 3
-
+ AGC_MAST 3
-
+ AGC_NDR 5
-
+ AGC_PDK1 1
-
+ AGC_PKA-PKG 1
-
+ AGC_RSK-2 17
-
-
+ Group CAMK (57 genes, 6 families)
-
+ CAMK_AMPK 1
-
+ CAMK_CAMK1-DCAMKL 1
-
+ CAMK_CAMKL-CHK1 20
- evm.TU.LG01.571
- evm.TU.LG01.577
- evm.TU.LG01.897
- evm.TU.LG01.900
- evm.TU.LG02.1715
- evm.TU.LG02.1942
- evm.TU.LG04.632
- evm.TU.LG06.257
- evm.TU.LG07.262
- evm.TU.LG07.434
- evm.TU.LG07.950
- evm.TU.LG07.1521
- evm.TU.LG09.46
- evm.TU.LG11.918
- evm.TU.LG11.919
- evm.TU.LG11.920
- evm.TU.LG11.1453
- evm.TU.LG12.55
- evm.TU.LG12.809
- evm.TU.LG12.810
-
+ CAMK_CAMKL-LKB 1
-
+ CAMK_CDPK 26
- evm.TU.LG01.1009
- evm.TU.LG01.1777
- evm.TU.LG01.1876
- evm.TU.LG01.2211
- evm.TU.LG01.2476
- evm.TU.LG01.2637
- evm.TU.LG02.1176
- evm.TU.LG02.2178
- evm.TU.LG02.2535
- evm.TU.LG02.2767
- evm.TU.LG03.2208
- evm.TU.LG04.639
- evm.TU.LG05.1243
- evm.TU.LG05.1871
- evm.TU.LG06.160
- evm.TU.LG06.1416
- evm.TU.LG08.28
- evm.TU.LG08.439
- evm.TU.LG09.119
- evm.TU.LG09.223
- evm.TU.LG10.871
- evm.TU.LG10.1332
- evm.TU.LG10.1475
- evm.TU.LG11.150
- evm.TU.LG11.816
- evm.TU.LG12.1123
-
+ CAMK_OST1L 8
-
-
+ Group CK1 (10 genes, 2 families)
-
+ Group CMGC (69 genes, 17 families)
-
+ CMGC_CDK-CCRK 1
-
+ CMGC_CDK-CDK7 1
-
+ CMGC_CDK-CDK8 1
-
+ CMGC_CDK-CRK7-CDK9 11
-
+ CMGC_CDK-PITSLRE 2
-
+ CMGC_CDK-Pl 3
-
+ CMGC_CDKL-Cr 2
-
+ CMGC_CK2 3
-
+ CMGC_CLK 5
-
+ CMGC_DYRK-PRP4 3
-
+ CMGC_DYRK-YAK 1
-
+ CMGC_GSK 7
-
+ CMGC_GSKL 1
-
+ CMGC_MAPK 13
-
+ CMGC_Pl-Tthe 2
-
+ CMGC_RCK 10
-
+ CMGC_SRPK 3
-
-
+ Group Others (33 genes, 15 families)
-
+ Aur 2
-
+ BUB 1
-
+ IRE1 2
-
+ NAK 2
-
+ NEK 5
-
+ PEK_GCN2 2
-
+ PEK_PEK 1
-
+ SCY1_SCYL1 1
-
+ SCY1_SCYL2 1
-
+ TLK 1
-
+ TTK 1
-
+ ULK_Fused 1
-
+ ULK_ULK4 1
-
+ WEE 2
-
+ WNK_NRBP 10
-
-
+ Group Plant-specific (6 genes, 3 families)
-
+ Group-Pl-2 1
-
+ Group-Pl-3 3
-
+ Group-Pl-4 2
-
-
+ Group RLK-Pelle (494 genes, 58 families)
-
+ RLK-Pelle_C-LEC 1
-
+ RLK-Pelle_CR4L 8
-
+ RLK-Pelle_CrRLK1L-1 10
-
+ RLK-Pelle_DLSV 94
- evm.TU.LG01.171
- evm.TU.LG01.172
- evm.TU.LG01.174
- evm.TU.LG01.175
- evm.TU.LG01.176
- evm.TU.LG01.178
- evm.TU.LG01.179
- evm.TU.LG01.1037
- evm.TU.LG01.1420
- evm.TU.LG01.2316
- evm.TU.LG01.2317
- evm.TU.LG01.2919
- evm.TU.LG01.2921
- evm.TU.LG01.2923
- evm.TU.LG01.2926
- evm.TU.LG03.581
- evm.TU.LG03.582
- evm.TU.LG03.1319
- evm.TU.LG04.1983
- evm.TU.LG04.1984
- evm.TU.LG04.1985
- evm.TU.LG04.1986
- evm.TU.LG05.326
- evm.TU.LG05.330
- evm.TU.LG05.1037
- evm.TU.LG05.1400
- evm.TU.LG05.1402
- evm.TU.LG05.1403
- evm.TU.LG05.1405
- evm.TU.LG05.1406
- evm.TU.LG05.1411
- evm.TU.LG05.1495
- evm.TU.LG05.1496
- evm.TU.LG05.1715
- evm.TU.LG05.1716
- evm.TU.LG05.1717
- evm.TU.LG05.1718
- evm.TU.LG05.1721
- evm.TU.LG05.1722
- evm.TU.LG05.1723
- evm.TU.LG05.1724
- evm.TU.LG05.1726
- evm.TU.LG07.224
- evm.TU.LG07.547
- evm.TU.LG08.1194
- evm.TU.LG09.395
- evm.TU.LG10.336
- evm.TU.LG10.721
- evm.TU.LG12.247
- evm.TU.LG12.572
- evm.TU.LG12.574
- evm.TU.LG12.575
- evm.TU.LG12.578
- evm.TU.LG12.579
- evm.TU.LG12.582
- evm.TU.LG12.583
- evm.TU.LG12.584
- evm.TU.LG12.585
- evm.TU.LG12.588
- evm.TU.LG12.590
- evm.TU.LG12.591
- evm.TU.LG12.592
- evm.TU.LG12.593
- evm.TU.LG12.594
- evm.TU.LG12.600
- evm.TU.LG12.601
- evm.TU.LG12.602
- evm.TU.LG12.603
- evm.TU.LG12.604
- evm.TU.LG12.605
- evm.TU.LG12.606
- evm.TU.LG12.607
- evm.TU.LG12.608
- evm.TU.LG12.610
- evm.TU.LG12.613
- evm.TU.LG12.683
- evm.TU.LG12.684
- evm.TU.LG12.685
- evm.TU.LG12.686
- evm.TU.LG12.750
- evm.TU.LG12.751
- evm.TU.LG12.753
- evm.TU.LG12.754
- evm.TU.LG12.755
- evm.TU.LG12.981
- evm.TU.LG12.1067
- evm.TU.LG12.1069
- evm.TU.LG12.1070
- evm.TU.LG12.1071
- evm.TU.LG12.1072
- evm.TU.LG12.1073
- evm.TU.LG12.1074
- evm.TU.LG12.1075
- evm.TU.LG12.1224
-
+ RLK-Pelle_Extensin 6
-
+ RLK-Pelle_L-LEC 15
-
+ RLK-Pelle_LRK10L-2 1
-
+ RLK-Pelle_LRR-I-1 8
-
+ RLK-Pelle_LRR-I-2 3
-
+ RLK-Pelle_LRR-II 13
-
+ RLK-Pelle_LRR-III 33
- evm.TU.LG01.167
- evm.TU.LG01.526
- evm.TU.LG01.615
- evm.TU.LG01.844
- evm.TU.LG01.949
- evm.TU.LG01.2153
- evm.TU.LG01.2382
- evm.TU.LG01.2426
- evm.TU.LG01.2835
- evm.TU.LG02.619
- evm.TU.LG02.732
- evm.TU.LG02.1925
- evm.TU.LG02.2082
- evm.TU.LG02.2100
- evm.TU.LG03.748
- evm.TU.LG03.969
- evm.TU.LG03.1498
- evm.TU.LG03.1519
- evm.TU.LG04.1515
- evm.TU.LG05.1974
- evm.TU.LG06.397
- evm.TU.LG07.578
- evm.TU.LG07.911
- evm.TU.LG07.1020
- evm.TU.LG07.1343
- evm.TU.LG08.528
- evm.TU.LG09.68
- evm.TU.LG10.145
- evm.TU.LG10.248
- evm.TU.LG10.790
- evm.TU.LG10.1492
- evm.TU.LG12.479
- evm.TU.LG12.586
-
+ RLK-Pelle_LRR-IV 3
-
+ RLK-Pelle_LRR-IX 4
-
+ RLK-Pelle_LRR-V 6
-
+ RLK-Pelle_LRR-VI-1 3
-
+ RLK-Pelle_LRR-VI-2 4
-
+ RLK-Pelle_LRR-VII-1 5
-
+ RLK-Pelle_LRR-VII-2 2
-
+ RLK-Pelle_LRR-VII-3 2
-
+ RLK-Pelle_LRR-VIII-1 11
-
+ RLK-Pelle_LRR-Xa 4
-
+ RLK-Pelle_LRR-Xb-1 10
-
+ RLK-Pelle_LRR-Xb-2 2
-
+ RLK-Pelle_LRR-XI-1 36
- evm.TU.LG01.649
- evm.TU.LG01.2363
- evm.TU.LG01.2442
- evm.TU.LG01.2489
- evm.TU.LG02.162
- evm.TU.LG02.2628
- evm.TU.LG02.2631
- evm.TU.LG03.2148
- evm.TU.LG03.2175
- evm.TU.LG04.1368
- evm.TU.LG04.1513
- evm.TU.LG04.1776
- evm.TU.LG05.1251
- evm.TU.LG05.2080
- evm.TU.LG06.189
- evm.TU.LG06.275
- evm.TU.LG06.276
- evm.TU.LG06.741
- evm.TU.LG06.1123
- evm.TU.LG06.1437
- evm.TU.LG06.1443
- evm.TU.LG06.1445
- evm.TU.LG06.1605
- evm.TU.LG07.175
- evm.TU.LG07.840
- evm.TU.LG07.1159
- evm.TU.LG08.683
- evm.TU.LG08.886
- evm.TU.LG10.700
- evm.TU.LG11.191
- evm.TU.LG11.195
- evm.TU.LG11.636
- evm.TU.LG11.646
- evm.TU.LG12.267
- evm.TU.LG12.296
- evm.TU.LG12.899
-
+ RLK-Pelle_LRR-XI-2 2
-
+ RLK-Pelle_LRR-XII-1 20
- evm.TU.LG01.1041
- evm.TU.LG02.1857
- evm.TU.LG04.1785
- evm.TU.LG04.2330
- evm.TU.LG05.457
- evm.TU.LG05.459
- evm.TU.LG06.1191
- evm.TU.LG06.1386
- evm.TU.LG06.1387
- evm.TU.LG06.1390
- evm.TU.LG10.736
- evm.TU.LG11.86
- evm.TU.LG11.88
- evm.TU.LG11.284
- evm.TU.LG12.336
- evm.TU.LG12.500
- evm.TU.LG12.501
- evm.TU.LG12.502
- evm.TU.LG12.671
- evm.TU.LG12.804
-
+ RLK-Pelle_LRR-XIIIa 5
-
+ RLK-Pelle_LRR-XIIIb 2
-
+ RLK-Pelle_LRR-XIV 2
-
+ RLK-Pelle_LRR-XV 3
-
+ RLK-Pelle_LysM 10
-
+ RLK-Pelle_PERK-1 8
-
+ RLK-Pelle_PERK-2 5
-
+ RLK-Pelle_RKF3 3
-
+ RLK-Pelle_RLCK-II 1
-
+ RLK-Pelle_RLCK-IV 3
-
+ RLK-Pelle_RLCK-IXa 4
-
+ RLK-Pelle_RLCK-IXb 11
-
+ RLK-Pelle_RLCK-V 8
-
+ RLK-Pelle_RLCK-VI 11
-
+ RLK-Pelle_RLCK-VIIa-1 11
-
+ RLK-Pelle_RLCK-VIIa-2 26
- evm.TU.LG01.149
- evm.TU.LG01.815
- evm.TU.LG01.1227
- evm.TU.LG01.1466
- evm.TU.LG02.147
- evm.TU.LG02.1056
- evm.TU.LG02.1737
- evm.TU.LG02.2870
- evm.TU.LG02.2871
- evm.TU.LG03.194
- evm.TU.LG03.210
- evm.TU.LG04.27
- evm.TU.LG05.480
- evm.TU.LG06.77
- evm.TU.LG07.587
- evm.TU.LG07.645
- evm.TU.LG07.646
- evm.TU.LG07.702
- evm.TU.LG07.1324
- evm.TU.LG08.426
- evm.TU.LG09.44
- evm.TU.LG09.346
- evm.TU.LG09.1262
- evm.TU.LG09.1263
- evm.TU.LG10.915
- evm.TU.LG10.1091
-
+ RLK-Pelle_RLCK-VIIb 1
-
+ RLK-Pelle_RLCK-VIII 4
-
+ RLK-Pelle_RLCK-X 2
-
+ RLK-Pelle_RLCK-XI 3
-
+ RLK-Pelle_RLCK-XII-1 6
-
+ RLK-Pelle_RLCK-XIII 1
-
+ RLK-Pelle_RLCK-XV 3
-
+ RLK-Pelle_RLCK-XVI 1
-
+ RLK-Pelle_SD-2b 14
-
+ RLK-Pelle_Singleton 1
-
+ RLK-Pelle_URK-1 2
-
+ RLK-Pelle_URK-2 2
-
+ RLK-Pelle_URK-3 1
-
+ RLK-Pelle_URK-Pp-1 1
-
+ RLK-Pelle_WAK 20
- evm.TU.LG08.854
- evm.TU.LG08.856
- evm.TU.LG08.858
- evm.TU.LG08.860
- evm.TU.LG08.864
- evm.TU.LG08.865
- evm.TU.LG08.867
- evm.TU.LG08.868
- evm.TU.LG08.869
- evm.TU.LG08.870
- evm.TU.LG08.873
- evm.TU.LG08.874
- evm.TU.LG08.875
- evm.TU.LG08.876
- evm.TU.LG08.879
- evm.TU.LG08.880
- evm.TU.LG08.881
- evm.TU.LG08.924
- evm.TU.LG08.925
- evm.TU.LG11.59
-
+ RLK-Pelle_WAK_LRK10L-1 13
-
-
+ Group STE (38 genes, 6 families)
-
+ STE_STE-Pl 1
-
+ STE_STE7 6
-
+ STE_STE11 24
- evm.TU.LG01.2753
- evm.TU.LG02.870
- evm.TU.LG02.2126
- evm.TU.LG02.2188
- evm.TU.LG03.2428
- evm.TU.LG04.2088
- evm.TU.LG05.764
- evm.TU.LG05.1903
- evm.TU.LG06.480
- evm.TU.LG06.971
- evm.TU.LG07.321
- evm.TU.LG07.322
- evm.TU.LG07.324
- evm.TU.LG07.328
- evm.TU.LG07.330
- evm.TU.LG07.333
- evm.TU.LG07.342
- evm.TU.LG08.937
- evm.TU.LG08.1300
- evm.TU.LG09.1069
- evm.TU.LG10.739
- evm.TU.LG10.1422
- evm.TU.LG11.1087
- evm.TU.LG12.1162
-
+ STE_STE20-Fray 5
-
+ STE_STE20-Pl 1
-
+ STE_STE20-YSK 1
-
-
+ Group TKL (48 genes, 11 families)
-
+ TKL-Pl-1 3
-
+ TKL-Pl-2 1
-
+ TKL-Pl-3 1
-
+ TKL-Pl-4 20
- evm.TU.LG01.885
- evm.TU.LG02.2288
- evm.TU.LG02.2289
- evm.TU.LG02.2831
- evm.TU.LG03.1033
- evm.TU.LG03.1034
- evm.TU.LG04.1123
- evm.TU.LG05.278
- evm.TU.LG05.402
- evm.TU.LG06.724
- evm.TU.LG06.1531
- evm.TU.LG07.635
- evm.TU.LG07.1642
- evm.TU.LG08.359
- evm.TU.LG10.665
- evm.TU.LG10.765
- evm.TU.LG10.776
- evm.TU.LG11.993
- evm.TU.LG12.947
- evm.TU.LG12.1200
-
+ TKL-Pl-5 3
-
+ TKL-Pl-6 7
-
+ TKL-Pl-7 1
-
+ TKL-Pl-8 1
-
+ TKL_CTR1-DRK-1 1
-
+ TKL_CTR1-DRK-2 8
-
+ TKL_Gdt 2
-