halophFGD - Protein Kinase Tree (Shiu)

Protein Kinases (Mesembryanthemum crystallinum)

Method. Protein kinases were predicted by iTAK.

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+ Group AGC (27 genes, 6 families)
- + AGC-Pl 3
- + AGC_MAST 2
  - gene_3126
  - gene_11329
- + AGC_NDR 4
- + AGC_PDK1 1
  - gene_9608
- + AGC_PKA-PKG 1
  - gene_10739
- + AGC_RSK-2 16
  - gene_643
  - gene_1295
  - gene_5660
  - gene_5952
  - gene_6515
  - gene_6785
  - gene_7120
  - gene_7659
  - gene_7969
  - gene_9016
  - gene_11656
  - gene_14435
  - gene_17224
  - gene_17504
  - gene_21935
  - gene_26579
+ Group CAMK (58 genes, 5 families)
- + CAMK_AMPK 2
  - gene_2535
  - gene_7076
- + CAMK_CAMKL-CHK1 19
  - gene_443
  - gene_1181
  - gene_1603
  - gene_2755
  - gene_5986
  - gene_8188
  - gene_8902
  - gene_9172
  - gene_10627
  - gene_12996
  - gene_13655
  - gene_14574
  - gene_20397
  - gene_20932
  - gene_21448
  - gene_22327
  - gene_22548
  - gene_24016
  - gene_24366
- + CAMK_CAMKL-LKB 1
  - gene_6740
- + CAMK_CDPK 28
  - gene_100
  - gene_1547
  - gene_2258
  - gene_2331
  - gene_3357
  - gene_4663
  - gene_8423
  - gene_9788
  - gene_9940
  - gene_10179
  - gene_10344
  - gene_11565
  - gene_11630
  - gene_12265
  - gene_14694
  - gene_15273
  - gene_15860
  - gene_15966
  - gene_16094
  - gene_18978
  - gene_19595
  - gene_21528
  - gene_21574
  - gene_21794
  - gene_23354
  - gene_23502
  - gene_23920
  - gene_24109
- + CAMK_OST1L 8
  - gene_1450
  - gene_2043
  - gene_11543
  - gene_16658
  - gene_17544
  - gene_24192
  - gene_24262
  - gene_26375
+ Group CK1 (10 genes, 2 families)
- + CK1_CK1 6
- + CK1_CK1-Pl 4
+ Group CMGC (53 genes, 17 families)
- + CMGC_CDK-CCRK 1
  - gene_9097
- + CMGC_CDK-CDK7 1
  - gene_6435
- + CMGC_CDK-CDK8 1
  - gene_10314
- + CMGC_CDK-CRK7-CDK9 11
  - gene_462
  - gene_824
  - gene_6163
  - gene_10052
  - gene_10159
  - gene_12459
  - gene_13813
  - gene_16470
  - gene_17373
  - gene_19785
  - gene_25901
- + CMGC_CDK-PITSLRE 2
  - gene_3533
  - gene_14028
- + CMGC_CDK-Pl 4
- + CMGC_CDKL-Cr 1
  - gene_2739
- + CMGC_CK2 2
  - gene_16729
  - gene_23991
- + CMGC_CLK 3
- + CMGC_DYRK-PRP4 3
- + CMGC_DYRK-YAK 1
  - gene_16407
- + CMGC_GSK 6
- + CMGC_GSKL 1
  - gene_19362
- + CMGC_MAPK 10
  - gene_1216
  - gene_2834
  - gene_7587
  - gene_14153
  - gene_14712
  - gene_15638
  - gene_20907
  - gene_23597
  - gene_24068
  - gene_25760
- + CMGC_Pl-Tthe 1
  - gene_9125
- + CMGC_RCK 2
  - gene_5413
  - gene_7311
- + CMGC_SRPK 3
+ Group Others (36 genes, 15 families)
- + Aur 2
  - gene_1364
  - gene_13207
- + BUB 1
  - gene_25917
- + IRE1 2
  - gene_8630
  - gene_13359
- + NAK 2
  - gene_4393
  - gene_13888
- + NEK 5
- + PEK_GCN2 4
- + PEK_PEK 1
  - gene_12461
- + SCY1_SCYL1 1
  - gene_6288
- + SCY1_SCYL2 1
  - gene_14307
- + TLK 1
  - gene_6874
- + TTK 1
  - gene_23394
- + ULK_Fused 3
- + ULK_ULK4 1
  - gene_4224
- + WEE 1
  - gene_5194
- + WNK_NRBP 10
  - gene_1612
  - gene_1736
  - gene_2576
  - gene_4795
  - gene_10071
  - gene_12157
  - gene_14577
  - gene_19179
  - gene_19470
  - gene_25546
+ Group Plant-specific (6 genes, 3 families)
- + Group-Pl-2 1
  - gene_2035
- + Group-Pl-3 3
- + Group-Pl-4 2
  - gene_18381
  - gene_20435
+ Group RLK-Pelle (554 genes, 57 families)
- + RLK-Pelle_C-LEC 1
  - gene_5036
- + RLK-Pelle_CR4L 10
  - gene_1472
  - gene_3547
  - gene_3819
  - gene_6899
  - gene_13405
  - gene_14248
  - gene_15852
  - gene_17004
  - gene_17559
  - gene_23475
- + RLK-Pelle_CrRLK1L-1 8
  - gene_5096
  - gene_7048
  - gene_7413
  - gene_12949
  - gene_16154
  - gene_19655
  - gene_20436
  - gene_26460
- + RLK-Pelle_DLSV 117
  - gene_146
  - gene_155
  - gene_156
  - gene_157
  - gene_158
  - gene_159
  - gene_160
  - gene_161
  - gene_175
  - gene_177
  - gene_178
  - gene_202
  - gene_203
  - gene_204
  - gene_205
  - gene_208
  - gene_209
  - gene_210
  - gene_212
  - gene_213
  - gene_214
  - gene_215
  - gene_216
  - gene_217
  - gene_218
  - gene_219
  - gene_221
  - gene_223
  - gene_4298
  - gene_5196
  - gene_5197
  - gene_5198
  - gene_5199
  - gene_7561
  - gene_7562
  - gene_7787
  - gene_8411
  - gene_8413
  - gene_8414
  - gene_8783
  - gene_10561
  - gene_12513
  - gene_12699
  - gene_12813
  - gene_12816
  - gene_14083
  - gene_14840
  - gene_14842
  - gene_14843
  - gene_14844
  - gene_14845
  - gene_14847
  - gene_15779
  - gene_15780
  - gene_15781
  - gene_15782
  - gene_15783
  - gene_15784
  - gene_15785
  - gene_15786
  - gene_15787
  - gene_16234
  - gene_18059
  - gene_18812
  - gene_18813
  - gene_19389
  - gene_20071
  - gene_21169
  - gene_22058
  - gene_22059
  - gene_22061
  - gene_22062
  - gene_22063
  - gene_22064
  - gene_22065
  - gene_22066
  - gene_22067
  - gene_22068
  - gene_22069
  - gene_22071
  - gene_22072
  - gene_22073
  - gene_22074
  - gene_22075
  - gene_22076
  - gene_22077
  - gene_22078
  - gene_22079
  - gene_22081
  - gene_22087
  - gene_22088
  - gene_22089
  - gene_22092
  - gene_22093
  - gene_22094
  - gene_22095
  - gene_22096
  - gene_22097
  - gene_22098
  - gene_22099
  - gene_22100
  - gene_22101
  - gene_22109
  - gene_22110
  - gene_22111
  - gene_22112
  - gene_22113
  - gene_22114
  - gene_22116
  - gene_22117
  - gene_22118
  - gene_22140
  - gene_22259
  - gene_22379
  - gene_22381
  - gene_25970
  - gene_25976
- + RLK-Pelle_Extensin 6
  - gene_6434
  - gene_6773
  - gene_11033
  - gene_12011
  - gene_19259
  - gene_25995
- + RLK-Pelle_L-LEC 22
  - gene_4820
  - gene_5866
  - gene_5994
  - gene_6965
  - gene_6966
  - gene_6970
  - gene_6971
  - gene_6972
  - gene_6973
  - gene_7136
  - gene_8236
  - gene_12096
  - gene_12097
  - gene_12098
  - gene_15445
  - gene_16434
  - gene_17867
  - gene_17956
  - gene_19106
  - gene_21426
  - gene_22847
  - gene_23772
- + RLK-Pelle_LRK10L-2 10
  - gene_4044
  - gene_4045
  - gene_4046
  - gene_16625
  - gene_16626
  - gene_16627
  - gene_23183
  - gene_23875
  - gene_23876
  - gene_26263
- + RLK-Pelle_LRR-I-1 8
  - gene_3462
  - gene_3465
  - gene_14190
  - gene_18050
  - gene_18400
  - gene_26080
  - gene_26082
  - gene_26083
- + RLK-Pelle_LRR-I-2 2
  - gene_7379
  - gene_24254
- + RLK-Pelle_LRR-II 8
  - gene_899
  - gene_3624
  - gene_3974
  - gene_8498
  - gene_9207
  - gene_10288
  - gene_16474
  - gene_22337
- + RLK-Pelle_LRR-III 30
  - gene_290
  - gene_1156
  - gene_1783
  - gene_2292
  - gene_3526
  - gene_4043
  - gene_5360
  - gene_6607
  - gene_6704
  - gene_7985
  - gene_8015
  - gene_9033
  - gene_9254
  - gene_13329
  - gene_13903
  - gene_14397
  - gene_14599
  - gene_16008
  - gene_16176
  - gene_16186
  - gene_16326
  - gene_16699
  - gene_16710
  - gene_17044
  - gene_17106
  - gene_19077
  - gene_20923
  - gene_24720
  - gene_25874
  - gene_26528
- + RLK-Pelle_LRR-IV 3
  - gene_1913
  - gene_16054
  - gene_23222
- + RLK-Pelle_LRR-IX 6
  - gene_2303
  - gene_5423
  - gene_5719
  - gene_13214
  - gene_19180
  - gene_26641
- + RLK-Pelle_LRR-V 6
  - gene_69
  - gene_4708
  - gene_6605
  - gene_6666
  - gene_21023
  - gene_22288
- + RLK-Pelle_LRR-VI-1 4
  - gene_3742
  - gene_11456
  - gene_14019
  - gene_15306
- + RLK-Pelle_LRR-VI-2 5
  - gene_1852
  - gene_7073
  - gene_12544
  - gene_17023
  - gene_22325
- + RLK-Pelle_LRR-VII-1 4
  - gene_1896
  - gene_4763
  - gene_14589
  - gene_17093
- + RLK-Pelle_LRR-VII-2 1
  - gene_22332
- + RLK-Pelle_LRR-VII-3 2
  - gene_1193
  - gene_24097
- + RLK-Pelle_LRR-VIII-1 6
  - gene_9918
  - gene_17664
  - gene_17665
  - gene_20443
  - gene_24268
  - gene_24269
- + RLK-Pelle_LRR-Xa 4
  - gene_3693
  - gene_10153
  - gene_13582
  - gene_16615
- + RLK-Pelle_LRR-Xb-1 6
  - gene_942
  - gene_5552
  - gene_12472
  - gene_13304
  - gene_17787
  - gene_19149
- + RLK-Pelle_LRR-Xb-2 1
  - gene_19658
- + RLK-Pelle_LRR-XI-1 48
  - gene_291
  - gene_1539
  - gene_3113
  - gene_4434
  - gene_5178
  - gene_5179
  - gene_6128
  - gene_6416
  - gene_6429
  - gene_6466
  - gene_7116
  - gene_8122
  - gene_8123
  - gene_8124
  - gene_8125
  - gene_8126
  - gene_8127
  - gene_8128
  - gene_8739
  - gene_8825
  - gene_8827
  - gene_8913
  - gene_9572
  - gene_9573
  - gene_10131
  - gene_10132
  - gene_10348
  - gene_11069
  - gene_11931
  - gene_12923
  - gene_12924
  - gene_13201
  - gene_13202
  - gene_13203
  - gene_13204
  - gene_13223
  - gene_13224
  - gene_13225
  - gene_16947
  - gene_16948
  - gene_17596
  - gene_18863
  - gene_18865
  - gene_19046
  - gene_19072
  - gene_19496
  - gene_22819
  - gene_23474
- + RLK-Pelle_LRR-XI-2 2
  - gene_6546
  - gene_17974
- + RLK-Pelle_LRR-XII-1 21
  - gene_318
  - gene_545
  - gene_4565
  - gene_6913
  - gene_12604
  - gene_12605
  - gene_12607
  - gene_12608
  - gene_13573
  - gene_15872
  - gene_15874
  - gene_15875
  - gene_15876
  - gene_15878
  - gene_15879
  - gene_18101
  - gene_21612
  - gene_21615
  - gene_26400
  - gene_26426
  - gene_26427
- + RLK-Pelle_LRR-XIIIa 3
  - gene_12615
  - gene_15117
  - gene_19600
- + RLK-Pelle_LRR-XIIIb 1
  - gene_8054
- + RLK-Pelle_LRR-XIV 1
  - gene_21655
- + RLK-Pelle_LRR-XV 2
  - gene_3855
  - gene_24968
- + RLK-Pelle_LysM 15
  - gene_1573
  - gene_3325
  - gene_5187
  - gene_5188
  - gene_5325
  - gene_6423
  - gene_6425
  - gene_13154
  - gene_14558
  - gene_15255
  - gene_16921
  - gene_16922
  - gene_16923
  - gene_16924
  - gene_26099
- + RLK-Pelle_PERK-1 11
  - gene_3966
  - gene_8168
  - gene_10707
  - gene_10708
  - gene_10709
  - gene_10711
  - gene_18061
  - gene_21335
  - gene_23812
  - gene_24236
  - gene_26415
- + RLK-Pelle_PERK-2 2
  - gene_5653
  - gene_22611
- + RLK-Pelle_RKF3 3
  - gene_1916
  - gene_6253
  - gene_17530
- + RLK-Pelle_RLCK-II 1
  - gene_20420
- + RLK-Pelle_RLCK-IV 3
  - gene_1688
  - gene_6930
  - gene_8953
- + RLK-Pelle_RLCK-IXa 2
  - gene_13863
  - gene_24966
- + RLK-Pelle_RLCK-IXb 13
  - gene_1699
  - gene_3106
  - gene_3242
  - gene_5897
  - gene_6608
  - gene_6753
  - gene_8013
  - gene_9351
  - gene_9352
  - gene_13030
  - gene_13152
  - gene_16140
  - gene_24158
- + RLK-Pelle_RLCK-Os 1
  - gene_14004
- + RLK-Pelle_RLCK-V 7
  - gene_3244
  - gene_10265
  - gene_15670
  - gene_16688
  - gene_21642
  - gene_23595
  - gene_25439
- + RLK-Pelle_RLCK-VI 11
  - gene_1068
  - gene_6254
  - gene_7836
  - gene_9174
  - gene_10292
  - gene_10808
  - gene_12028
  - gene_18706
  - gene_23903
  - gene_24157
  - gene_26687
- + RLK-Pelle_RLCK-VIIa-1 10
  - gene_3488
  - gene_6470
  - gene_7075
  - gene_8638
  - gene_11938
  - gene_12320
  - gene_18655
  - gene_20979
  - gene_22037
  - gene_25016
- + RLK-Pelle_RLCK-VIIa-2 23
  - gene_1278
  - gene_1767
  - gene_2495
  - gene_3749
  - gene_5600
  - gene_5886
  - gene_6214
  - gene_6726
  - gene_6992
  - gene_7987
  - gene_8639
  - gene_9290
  - gene_10547
  - gene_10614
  - gene_13368
  - gene_14267
  - gene_14909
  - gene_14961
  - gene_16564
  - gene_18207
  - gene_18664
  - gene_20449
  - gene_26337
- + RLK-Pelle_RLCK-VIIb 1
  - gene_18159
- + RLK-Pelle_RLCK-VIII 4
  - gene_2704
  - gene_2738
  - gene_4727
  - gene_14802
- + RLK-Pelle_RLCK-X 2
  - gene_8199
  - gene_26260
- + RLK-Pelle_RLCK-XI 3
  - gene_14041
  - gene_16074
  - gene_23254
- + RLK-Pelle_RLCK-XII-1 7
  - gene_1709
  - gene_1838
  - gene_2096
  - gene_2442
  - gene_5831
  - gene_8662
  - gene_26354
- + RLK-Pelle_RLCK-XIII 1
  - gene_15105
- + RLK-Pelle_RLCK-XV 1
  - gene_26212
- + RLK-Pelle_RLCK-XVI 1
  - gene_20820
- + RLK-Pelle_SD-2b 31
  - gene_2455
  - gene_2457
  - gene_2458
  - gene_2459
  - gene_2460
  - gene_3631
  - gene_4666
  - gene_4670
  - gene_4785
  - gene_7482
  - gene_8410
  - gene_9019
  - gene_10512
  - gene_15421
  - gene_15425
  - gene_16179
  - gene_18116
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  - gene_25178
  - gene_26391
- + RLK-Pelle_Singleton 1
  - gene_13219
- + RLK-Pelle_URK-1 2
  - gene_5736
  - gene_26576
- + RLK-Pelle_URK-3 1
  - gene_1590
- + RLK-Pelle_WAK 35
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- + RLK-Pelle_WAK_LRK10L-1 14
  - gene_3712
  - gene_4050
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  - gene_24198
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  - gene_26264
+ Group STE (24 genes, 6 families)
- + STE_STE-Pl 1
  - gene_20540
- + STE_STE7 7
  - gene_3081
  - gene_9128
  - gene_9566
  - gene_11012
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  - gene_15040
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- + STE_STE11 9
  - gene_1518
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  - gene_17938
  - gene_22008
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  - gene_23944
- + STE_STE20-Fray 5
- + STE_STE20-Pl 1
  - gene_18856
- + STE_STE20-YSK 1
  - gene_12478
+ Group TKL (39 genes, 10 families)
- + TKL-Pl-1 2
  - gene_24422
  - gene_25197
- + TKL-Pl-2 1
  - gene_4254
- + TKL-Pl-3 1
  - gene_4542
- + TKL-Pl-4 17
  - gene_57
  - gene_2542
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  - gene_12037
  - gene_12162
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  - gene_23644
  - gene_24221
- + TKL-Pl-5 3
- + TKL-Pl-6 5
- + TKL-Pl-7 1
  - gene_7070
- + TKL_CTR1-DRK-1 1
  - gene_21184
- + TKL_CTR1-DRK-2 6
- + TKL_Gdt 2
  - gene_1653
  - gene_24291